Moleküle Model-Editor

Grid Modus
Grid muss aus sein damit andere Clicks auf dem Canvas wirksam sind.
Kamera Blickpunkt ändern Die Kamera soll auf diese Koordinaten schauen:








Wenn Du die linke MauseTaste gedrückt hälst und dann in der Scene die Maus begwegst kannst du die Camera der Scene drehen.

Verwende das Scrollrad der Mause wenn der Mauszeiger über der Scene ist, fürs Zoomen.

Mit einem Doppelklick setzt du eine Sphere und deren Ansatzpunkte als aktuelles Bearbeitungsobject.

Es erscheinen mögliche Ansatzpunkte(die kleinen Spheren). Du kannst zum Beispiel eine Farbe festlegen, die für das Hinzufügen der nächsten Sphere verwendet wird. Und viele weitere Aktionen ausführen, die für die nächsten Ansatzpunkte verwenden werden oder die markierte Sphere beeinflussen.

Mit einem Doppelklick auf einen Ansatzpunkt, werden die eingestellten Werte verwendet um eine weitere Sphere, als "Child" der markierten Sphere, der Scene hinzuzufügen.

Mit einem Doppelklick ins "Schwarze" hebst Du die Kennzeichnung der Sphere auf. Das musst Du auch tun bevor eine andere Sphere als aktuelles Bearbeitungsobject ausgewählt werden kann.

Wähle danach eine andere Sphere als aktuelles Bearbeitungsobject.

Reagiert der Anzeigebreich nicht so richtig auf Clicks? Dann scrolle die Webseite, zurück ganz nach oben bzw. nach links.

Die Ansatzpunkte muss man sehr genau in der Mitte treffen. Scrolle dichter an den gewünschten Ansatzpunkt heran.

Um unbeabsichtige Ansatzaktion zu vermeiden, wenn man sich nur durch die Scene bewegen möchte, kann man das Ausführen dieser Aktionen über die Radiobutton im Bereich "Ansatz Modus" ausschalten. Um dann erst unmittelbar vor dem Ansatzclick diese Aktion einzuschalten.

Zur Zeit ist es noch nicht vorgesehen einen Account zu erhalten mit dem ein Login ausgeführt werden kann.

Als Eingeloggter User könnte man die erstellten "Moleküle" speichern und wieder laden. Und ganze gespeicherte Moleküle an einem Ansatzpunkt mit einem Doppelclick hinzufügen.

Im Bereich "Laden Public Examples" werden gespeicherte Beispiele aufgelistet.

Dieser Moleküle-Editor ist noch in der Entwicklungsphase.

Cif File load

Cif Files sind Crystallographic Information Files. Wähle ein Cif File:
Lade Beispiele von Quellen:
https://www.rcsb.org/3d-view/1GZX https://files.rcsb.org/download/1gzx.cif
https://www.rcsb.org/3d-view/4C2T https://files.rcsb.org/download/4c2t.cif
Nach dem Download dann für den Import auswählen
Beim 2.Beispiel ist mit längerer ImportZeit zu rechnen.
Und man muss für die Ansicht dann weit rauszommen.

Laden Public Examples

   
   
Farbe für Ansatzsphere ändern/vormerken:



Infomation

Die Spheren sind die Modelle für die einzelnen Atome in den Molekülen. Du kannst für jede Sphere eine beliebige Farbe auswählen bzw. festlegen. Aber um die jeweiligen Chemischen Elemente, in den Modellen, wiederzuerkennen ist es angebracht sich für eine bestimmte Farbzuordnung zu entscheiden. z.B.

  • Rot für Wasserstoff
  • Grau für Kohlenstoff
  • Blau für Sauerstoff
  • Grün für Phosphor
  • Cyan für Stickstoff
  • Yellow für Schwefel

Ansatz Modus
Information Hier kannst Du einstellen was beim Click auf einen der Ansatzpunkte geschieht.
  • eine einzelne Sphere wird angesetzt

Um unbeabsichtige Ansatzaktion zu vermeiden, wenn man sich nur durch die Scene bewegen möchte, kann man das Ausführen dieser Aktion über den Radiobutton "Ansetzen aus" ausschalten. Um dann erst unmittelbar vor dem Click zum Ansetzen mit "Ansetzen an" diese Aktionsmöglichkeit zu aktiveren Es besteht die Möglichkeit zuerst zu kontrollieren ob man richtige Sphere fürs Ansetzen aktiviert hat, indem man unter "Daten von markierter Sphere" den "Read" Button verwendet.


Bewegen von Molekülen















Radius für Ansatzsphere



Infomation Für die Modelierung wird zur Vereinfachung der "kovalente Radius" der jeweiligen Chemischen Elemente als Richtwert verwendet. Kovalente Radien sind ja auch abhängig von der Art der Chemischen Bindung und den Bindungspartnern.
Wenn man die Daten zu einer Sphere unter "Daten von markierter Sphere" eingelesen hat kann man auch den Radius (den internen Wert des Radius) bearbeiten und dann mit "Add" an beliebiger Position eine Sphere mit dem selbst gewählten Radius hinzufügen. Somit ist man nicht auf die hier aufgeführten Radien beschränkt und kann somit seine Modelle auch in diesem Darstellungsaspekt verfeinern.
Distanz zur nächsten Sphere









Informationen die Ratiobuttons setzen direkt den Distanzwert für die nächste verwendung Wenn man einen ganz Speziellen Wert benötigt kann man diesen in das Eingabefeld eintragen Und beim Click auf den Button wird dieser Wert für die Verwendung vorgemerkt. Bis ein anderer Wert gewählt wird. Beispielwert: 1.37
Ansatz WinkelTyp
SpezialAnsatz



Informationen in den allermeisten Organischen Molekülen wird eine Struktur angestrebt die einen minimalen Energienaufwand erfordert. Die tatsächlichen Winkel sind häufig dann auch von den Wechselwirkungen der Moleküle untereinander abhänig und verändern sich wärend Chemische Reaktion stattfinden. Die hier auswählbaren Winkel helfen schnell Modelle zu erstellen die die tatsächliche Raumstruktur angenähert abbilden. Benötigt man einen Ansatz mit einem Speziellem Winkel kann man einen Wert in das Feld "Spezieller Winkel Wert" eingeben. Und man muss dann einen Weiteren Winkel angeben der dem Rotationswinkel um die Y-Achse im Koordinatensystem des Ansatzatoms entspricht.
Rotations Winkel der Ansatzsphere
Infomation

Was wird durch den Rotationswinkel bewirkt? Jede Sphere hat ja neue "Ansatzpunkte" die beim markieren der Sphere sichtbar werden. Doch wo erscheinen diese Ansatzpunkte wenn man von der "Elternsphere" aus in die Richtung blickt in der diese Sphere angefügt wird? Der Rotationswinkel bewirkt eine Drehung, um die Achse durch die Positionen von Elternsphere und Ansatzsphere gebildet wird. Die neuen Ansatzpunkte erscheinen gedreht um diese Achse in einem anderen Winkel. Hier kann bei Klick auf "Rotationswinkel ändern" somit die Position der Ansatzpunkte und auch der bereits angefügten Spheren geändert werden. Es ändert sich tatsächlich die Position der Ansatzpunkte und der Spheren, und deren Kinder. Es ist keine keine Veränderung der Kameraposition. Beim Klick auf "Ansatz Rotationswinkel vormerken" wird der Wert für weitere anfügungen von neuen Spheren Anwendung finden.

Daten von markierten Spheren lesen
Erste Sphere:




























zweite Sphere




























Infomation Du kannst die Daten in den Feldern bearbeiten. und dann mit "Add" eine neue Sphere hinzufügen die nicht ein Kind der markierten Sphere ist.
Einen Namen für die nächste angefügte Sphere festlegen

Information Wenn man einer Sphere einen Namen gibt, kann man später beim arbeiten an größeren Modellen sicherer erkennen ob man für den nächsten Bearbeitungsschritt die "Richtige Sphere" als Bearbeitungpunkt ausgewählt hat. Im Bereich "Daten von markierten Spheren lesen" wird beim Klick auf "Read" auch der Name ausgegeben.
Swing Rotation Animation

Infomation /Beispiel Es sind durch Semicolon getrennt eingengebene Sekunden Werte anzugeben
z.B. 0;30;40;100;110;120
diese werden den Animations Schlüsselwerten zugeordnet
z.B. 0;0;11;11;0;0 kein Semikolon am Ende
diese Werte Reihen werden einander zugeordnet und für die Animation Zwischenwerte des Values Interpoliert Im Beispiel ändert sich der Value des Rotionswinkel nicht zwischen der Zeit 0 bis 30
und auch nicht zwischen der Zeit 40 und 100, und nicht zwischen der Zeit 110 und 120 nur zwischen 30 und 40 ändert sich der Wert von 0 auf 11 (Das ist aber nicht die Gradzahl der rotation) und zwischen 100 und 110 ändert sich der Wert von 11 auf 0





Shere Ansetzen mit Weltkoordinaten.








Infomation Du hat eine Shere makiert. Und möchtet eine Sphere ansetzen die dann Im WeltkoordinatenSystem die Koordinaten hat die in diesem Formular angebeben sind.
Entferne den markierten Ansatz and dessen "Childs"!
Zum Login
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